O Centro São Cirilo teve vários projetos ativos, complementares ao trabalho organizado do dia-a-dia. Foram eles:
- Projeto São Cirilo em Movimento (a decorrer)
- Projeto Bé-à-Bá do Serviço Doméstico (Prémio BPI Solidário 2016)
- Projeto Integração Segura 2 (financiamento europeu FAMI para apoio ao funcionamento do Gabinete de Emprego 2015)
- Projeto Integração Segura (co-financiado pelo FEINPT -Fundo Europeu para a Integração de Nacionais de Países Terceiros para apoio ao funcionamento do Gabinete de Emprego 2014)
- Projeto Mentores para Migrantes (Alto Comissariado para as Migrações 2014)